Beschaffung eines STORM-Mikroskops (DFG-GZ: A 717)

Deutsche Forschungsgemeinschaft e. V., Zentrale Beschaffungsstelle

Leistungsbeschreibung des Superresolution STORM-Systems:

Deadline

Die Frist für den Eingang der Angebote war 2016-02-05. Die Ausschreibung wurde veröffentlicht am 2016-01-04.

Anbieter

Die folgenden Lieferanten werden in Vergabeentscheidungen oder anderen Beschaffungsunterlagen erwähnt:

• Nikon GmbH

Wer?

• Deutsche Forschungsgemeinschaft e. V., Zentrale Beschaffungsstelle

Wie?

• Laborgeräte, optische Geräte und Präzisionsgeräte (außer Gläser)

Wo?

• Tübingen › Tübingen, Landkreis

Geschichte der Beschaffung

Datum	Dokument
2016-01-04	Auftragsbekanntmachung
2016-07-25	Bekanntmachung über vergebene Aufträge

Auftragsbekanntmachung (2016-01-04)
Objekt
Umfang der Beschaffung
Titel: Laborgeräte, optische Geräte und Präzisionsgeräte (außer Gläser)
Menge oder Umfang: 1 System.
Metadaten der Bekanntmachung
Originalsprache: Deutsch 🗣️
Dokumenttyp: Auftragsbekanntmachung
Art des Auftrags: Lieferungen
Verordnung: Europäische Union
Gemeinsames Vokabular für öffentliche Aufträge (CPV)
Code: Laborgeräte, optische Geräte und Präzisionsgeräte (außer Gläser) 📦

Verfahren
Verfahrensart: Verhandlungsverfahren
Angebotsart: Angebot für alle Lose
Vergabekriterien
Wirtschaftlichstes Angebot

Öffentlicher Auftraggeber
Identität
Land: Deutschland 🇩🇪
Art des öffentlichen Auftraggebers: Sonstiges
Name des öffentlichen Auftraggebers: Deutsche Forschungsgemeinschaft e. V., Zentrale Beschaffungsstelle
Postanschrift: Kennedyallee 40
Postleitzahl: 53175
Postort: Bonn
Kontakt
Internetadresse: http://www.dfg.de 🌏
E-Mail: christina.lindau@dfg.de 📧
Telefon: +49 2288852215 📞
Fax: +49 2288853676 📠

Referenz
Daten
Absendedatum: 2016-01-04 📅
Einreichungsfrist: 2016-02-05 📅
Veröffentlichungsdatum: 2016-01-06 📅
Kennungen
Bekanntmachungsnummer: 2016/S 003-002463
ABl. S-Ausgabe: 3
Zusätzliche Informationen

Das Aktenzeichen entsprechend Ziff. IV.3.1) ist bei sämtlicher Korrespondenz anzugeben. Beim Schlusstermin laut Ziff. IV.3.4) handelt es sich um den Schlusstermin für den Eingang der Teilnahmeanträge (nicht für den Eingang der Angebote). Vor Ablauf des Schlusstermins gemäß Ziff. IV.3.4) werden keine Verdingungsunterlagen versendet.

Objekt
Umfang der Beschaffung
Kurze Beschreibung:

Leistungsbeschreibung des Superresolution STORM-Systems:

Es soll ein Superresolution-System angeschafft werden, welches möglichst viele verschiedene STORM-Methoden durchführen kann. So kann abhängig von der Zielsetzung des Experiments von den Vorteilen der einzelnen Methoden profitiert werden und man ist nicht auf eine beschränkt. Im Prinzip gibt es drei Methoden, die sich in der Belichtungssequenz (illumination sequences) unterscheiden, die wiederum von dem Typ des Farbstoffes (Tandem-Farbstoffpaar oder Einzelfarbstoff) und dem Zustand der zu beobachteten Probe (fixiert oder lebendig) abhängt.

1. Sequentielle Aktivierung unter Nutzung von Tandem-Farbstoffpaaren (Aktivator-Reporter Paar). Dies ermöglicht ein Multicolor Superresolution Imaging frei von chromatischen Abweichungen zwischen den einzelnen Farbkanälen (Zhuang, Science Vol. 317 (2007)).

2. Kontinuierliche Aktivierung von Einzelfarbstoffen (z. B. dSTORM). Auch hier soll das System und die Software die Aufnahme von mindestens drei Farbkanälen in einer flexibel definierbaren Belichtungssequenz ermöglichen. Chromatische Abweichungen können durch einen 3D-Kalibrierung korrigiert werden.

3. Kontinuierliche Aktivierung in Time-Lapse für Superresolution Live-Cell-Imaging.

Der letzte Punkt ist sehr wichtig, dass das System in der Lage sein soll, STORM in einer Zeitserie (Time-Lapse) durchführen zu können. Dies erfordert ein System, welches die extrem hohe Bildfrequenz mit der dafür erforderlichen Kamera- und Lasertechnologie leisten kann.

Das System soll neben der Auflösungsverbesserung in lateral in xy (20 nm, 2D-STORM) auch eine Auflösungsverbesserung in axial in z (50 nm, 3D-STORM) ermöglichen. Dieses 3D-STORM soll mit allen oben genannten Belichtungssequenzen kombiniert werden können.

Multicolor Superresolution Imaging sollen mindestens für drei Farbkanäle möglich sein und in einem Experiment in einer Belichtungssequenz ohne großen zeitlichen Versatz aufgenommen werden können, was eine flexible Software hierzu erfordert.

Mittels eines Dual-Kamera-Systems soll die simultane Aufnahme von zwei Farbstoffkanälen ermöglicht werden. Mit simultanen dual-color STORM Bildsequenzen wird spektrales Entmischen (Demixing) möglich sein (z.B. für CF680/Alexa647). Dieses Dual-Kamera-System muss aber die nötige Flexibilität haben, zwischen verschiedenen Farbstoffkombinationen (z. B. Alexa488/Alexa568 oder Alexa568/Alexa647) motorisch und softwaregesteuert zu wechseln, so dass kein Aufwand für Konfigurationswechsel erforderlich sein wird.

Technische Spezifikationen im Detail:

Anforderungen für STORM:

— Auflösung lateral (xy) 20 nm, axial (z) 50 nm.

— Zylindrische Linse (Astigmatismus-Linse) für die 3D-STORM Methode, um die axiale Auflösung von 50 nm zu erreichen. Die zylindrische Linse muss motorisch über die Software gesteuert in den Strahlengang ein- und ausgefahren werden, damit unkompliziert zwischen 2D- und 3D-STORM über Software-Konfigurationen umgeschaltet werden kann.

— TIRF-Illuminator, um STORM mit TIRF-Beleuchtung kombinieren zu können. Dadurch erreicht man auch eine Verbesserung der z-Auflösung im Bereich von 100 nm.

— Laser-Combiner mit 405/488/561/647 nm Wellenlänge. Laser mit mindestens folgender Laserleistung und Leistungsdichte an der Probe:

o 405 nm Wellenlänge: 67 mW Leistung am Laserkopf, 20 mW Leistung am Faserausgang, kA.zur Leistungsdichte an der Probe;

o 488 nm Wellenlänge: 120 mW Leistung am Laserkopf, 70 mW Leistung am Faserausgang, 5 kW/cm

o 561 nm Wellenlänge: 120 mW Leistung am Laserkopf, 70 mW Leistung am Faserausgang, 5 kW/cm

o 647 nm Wellenlänge: 300 mW Leistung am Laserkopf, 125 mW Leistung am Faserausgang, 9 kW/cm

— 647 nm Laser (kein Standard 640 nm Laser) für optimale Anregung von Alexa647, welches ein für STORM wichtiger Farbstoff ist.

— Bildaufnahme mit einer Frequenz bis zu 500 Hz. Mit dieser hohen Bildrate ist es möglich, die Daten für ein STORM-Bild in 2 bis 4 Sekunden zu generieren. Damit sind dann STORM-Zeitserien (Time-Lapse ) möglich, um dynamische Prozesse in der Zelle zu erfassen (Live Cell Imaging).

— sCMOS Kamera (Ausstattung s. „Anforderungen an die Kamera“) mit den Daten zur Korrektur für jedes Pixel (noise correction data of each pixel by Gain mapping and Dark-offset mapping).

— TIRF-Illuminator für die Einkopplung des Lasers und Beleuchtung der Probe. Der Illuminator soll die Möglichkeit der Verstärkung der Laserintensität um mindenstens den Faktor 2x und 4x haben, um in der Probe nach Bedarf eine höhere Leistungsdichte zu erzeugen. TIRF Beleuchtung wird auch benötigt, um einen besseren Kontrast zu erzeugen.

— Rechteckige Feldblende zur exakten Begrenzung der Ausleuchtung auf das jeweilige FOV der Kamera.

— TIRF Objektiv Apochromat 100x HP (High Power) mit N.A. 1,49 und Deckglaskorrektur für die beiden Temperaturbereiche 23°C und 37°C. Das Objektiv muss für die hohen Laserleistungen spezifiziert sein, um eine langfristige Verwendung mit den für STORM notwendigen hohen Laserleistungen zu gewährleisten.

— STORM Akquisition muss folgende verschiedenen Methoden aufweisen:

o Multicolour continuous-STORM mit bis zu 3 Farben simultan.

o STORM (Tandem-Farbstoffpaaren, Aktivator-Reporter Paar) ermöglicht Multicolour Imaging mit identischer Emissionswellenlänge für verschiedene STORM-Kanäle.

o Multicolour continuous-STORM in Kombination mit Time-Lapse.

Weitere Funktionen der STORM Akquisition zusätzlich zu der STORM-Rekonstruktion und Darstellung:

o Setzen von verschiedene Bildgrößen (Field of View, FOV) wie 512 x 512 (80 µm x 80 µm), 256 x 256 (40 µm x 40 µm)und 128 x 128 (20 µm x 20 µm), die mit den über den Verstärkungslinsen (2x und 4x) im TIRF-Illuminator und dem dadurch erzeugten beleuchtetem FOV korrelieren.

o Cross-Talk Correction.

o Softwarebasierte Drift Korrektur.

o Drift Korrektur mittels fluoreszierender Beads (fiducial marker beads).

o Software basierte Korrektur von chromatischen Aberrationen in XYZ.

o Online Darstellung des Superresolution Bildes während der Aufnahme.

o Online-Darstellung der detektierten Moleküle pro Zeitpunkt während der Aufnahme.

o Automatische Korrektur der Laserleistung des Aktivatorlasers während der Aufnahme, um die Anzahl der detektierten Moleküle pro Zeitpunkt konstant zu halten.

o Batch- Analyse mehrerer STORM Datensätze.

Anforderungen Mikroskop:

— Vollmotorisiertes inverses Mikroskop mit Fokusassistenten.

— Z-Trieb mit Linear Encoder 25 nm Schrittweite (Genauigkeit 25 nm): hochpräziser Z-Fokus, garantiert Fokusstabilität bei Nutzung des Perfect Focus Systems.

— Hardwarebasierter Fokusassistent hält den Fokus über die Dauer des Experiments konstant und verhindert so jeden Fokusdrift.

o Die Fokus-Kontrolle muss kontinuierlich in Echtzeit erfolgen und darf die STORM-Bildaufnahme ein keiner Weise beeinflussen oder unterbrechen.

o Der Fokus in der Probe muss unabhängig durch einen Offset eingestellt werden können. Dies soll durch eine optische Offset-Linse ermöglicht werden, da diese eine Fokusstabilisierung ohne Fokuspunktveränderung des Objektivs garantiert.

o Die kontinuierliche Fokuskorrektur muss auch während der Tischbewegung funktionieren. So kann schnell ohne ständiges Nachfokussieren die Probe nach geeigneten Stellen durchsucht werden. Dies reduziert die Belastung der Probe.

o In der Software muss es die Möglichkeit geben, verschiedene Fokus-Offset Positionen für beliebig viele XY Punkte zu speichern.

o Fokuskontrolle bei 870 nm. Beeinflusst damit nicht die Fluoreszenz aller gängigen Farbstoffe.

o Die Einkopplung des Fokusassistenten soll bei Bedarf jederzeit motorisiert aus dem Strahlengang gefahren werden können.

o Plastikboden-Probenschälchen sollen ebenfalls verwendbar sein.

o Experimente mit z.B. wechselnden Temperaturbedingungen oder Lösungswechseln während der Zeitserie können ohne Probleme durchgeführt werden.

— Motorisierter Laser-TIRF-Illuminator kombiniert mit LED basierter Weitfeld-Fluoreszenz-Einrichtung.

— High Performance TIRF System für reproduzierbare und automatische Einstellungen:

o automatisierte Einstellung des TIRF Winkels.

o automatischer Laserfokus.

o reproduzierbare Einstellung des TIRF-Winkels und damit der Eindringtiefe der Beleuchtung in Abhängigkeit der verwendeten Wellenlänge.

o Verstärkung und Konzentration der Laserdichte in der Probe durch motorisches Linsensystem (Verstärkung Faktor 1x, 2x und 4x).

o Homogenere Bildausleuchtung als beim herkömmlichen TIRF durch graduellen ND Filter. Lambda/4 Platte im TIRF Strahlengang.

— STORM Einkopplung über die TIRF Einkopplung unter Verwendung der TIRF-Laser. TIRF-System auch für TIRF-Imaging frei nutzbar;

— Objektive:

o Plan Fluor ELWD Objektiv 20x zur Einstellung der Probe.

o TIRF Objektiv Apochromat 100x HP (High Power, siehe auch STORM-Spezifikationen);

— xy-Motortisch mit bidirektionale Repositionierungsgenauigkeit: < 1 μm;

— z-Piezo Tischeinsatz mit einem Verfahrweg von 300 µm;

— LED-Durchlichtbeleuchtung;

— Filterwürfel speziell für Laser-TIRF;

o 488 nm Einzelband.

o 561 nm Einzelband.

o Quadband 405/488/561/640.

o STORM Filterwürfel (DM T660LPXR, BA ET705/72m, oder gleichwertig).

— Zweite Fluoreszenzebene mit Kamera-Port (Back-Port) zum Anschluss einer zweiten sCMOS-Kamera (Ausstattung s. „Anforderungen an die Kamera“). Hiermit ist die simultane Aufnahme von zwei Fluoreszenzkanälen möglich. Keine Einschränkung des FOV wie z. B. mit Splitter (DualView oder Optosplit). Eine flexible Wahl des Dualband-Filterwürfels ist durch einen motorisierten Filterblockrevolver möglich und kann einfach durch vordefinierte Software-Konfigurationen gewählt werden. Dies erfordert eine Mikroskopbasis, die über zwei zentrale Achsen (TIRF-Illuminator-Achse und Kamera-Back-Port-Achse) verfügt. Die TIRF-Illuminator-Achse und die Kamera-Back-Port-Achse sind jeweils mit motorischen Filterblockrevolver und Filtersets ausgestattet, so dass flexibel über Software verschiedene Farbstoff/Filter-Kombinationen für die STORM-Beleuchtung und für die Farbtrennung (Dual-Color) auf die beiden Kameras für simultanes dual-color Imaging automatisch gewechselt werden kann.

— Das Mikroskopsystem soll eine flexible Modularität aufweisen, die zukünftige Erweiterungen mit weiteren Illuminatoren (z. B. DMD, SIM) ohne Austausch von Komponenten ermöglicht.

Anforderungen an die Kamera:

— 4,0 Megapixel passiv luftgekühlte Digitalkamera;

— Quantum efficiency value QE > 70 %;

— Gain mapping and Dark-offset mapping zur Rausch-Korrektur in jedem Pixel;

— Camera-Link Verbindung (benötigt für die Hochfrequenz-Bildaufnahme 100 frames/s);

— Bildsensor: scientific CMOS sensor FL-400;

— Framerrate bei voller Auflösung: 100 Bilder pro Sekunde;

— Belichtungszeit: 9.7 µs bis 10 s;

— Dynamischer Bereich: 23000:1;

— Ausleserauschen: 1,3 Electronen;

— Lens mount: C-mount;

— Inkl. PCI express X8 Firebird-Framegrabber-Board, QC-Data und alle benötigten Kabel.

Anforderungen an die Software:

Eine Software wird gefordert, die neben der STORM Akquisition und STORM Analyse auch alle Steuerfunktionen der Hardware-Komponenten übernimmt und auch umfangreiche Funktionen zur Bildanalyse liefert. Durch Motorisierung und Softwaresteuerung soll das STORM-System benutzerfreundlich bedienbar sein und durch in der Software gespeicherte Konfigurationen eine einfache und schnelle Bedienung des komplexen Systems gewährleistet sein.

— Unterstützung der simultanen Aufnahme mit 2 identischen Kameras mit Speicherung der Bilddaten in ein Dokument als Zweikanal-Bild.

— Vollständige Mikroskopsteuerung, Zusammenfassung der Hardware-Einstellungen in Softwarekonfigurationen, damit das komplexe System einfach und benutzerfreundlich bedient werden kann.

— Bilddokumentation und -analyse bis hin zu einem umfangreichen Datenmanagement.

— vollautomatische Bilderfassung in 6 Dimensionen* (X, Y, Z, Lambda (Wellenlänge), Zeit, Multipoint, Panoramabild).

— Erstellung von 3D-Animationen in übereinander gelagerten Kanälen eine breite Palette von Bild-Analyse-Tools für die automatische Auswertung (automatisches Zählen, Kolokalisation, Fluoreszenz-intensitäten, Objektgröße, -umfang, -ausdehnung, -schwerpunkt etc., inkl. Statistiken und Export-Möglichkeit).

Anforderung an den Computer:

Leistungsstarker Computer, der die große Datenmenge pro Zeiteinheit bearbeiten kann (Folgende Konfiguration oder vergleichbar):

— Dual Intel® Xeon® E5-2687 10Core oder gleichwertig;

— 64 GB RAM; 2x 512GB SSD Festplatte; 2TB Festplatte;

— Grafikkarte nVidia Quadro K4200 oder gleichwertig;

— Zwei 24“ TFT Bildschirme;

Schwingungsgedämpfter Tisch:

— Labortisch 900 mm x 1 200 mm x 100 mm mit Gewinden M6 im Raster 25 mm;

Weitere Ausstattung:

— Offline Lizenz incl. vollwertiger STORM Analyse;

— Inkubator mit CO2 und Temperaturkontrolle (benötigt für Live-Cell Imaging);

— Weitere Objektive: 60x Apochromat Ölimmersion N.A. 1,4, mit erweiterten Wellenlängenbereich (405-665 nm) für Live Cell Imaging (optional).

Es werden Varianten akzeptiert ✅
Referenznummer: EXC 307/2015
Ort der Leistung
Hauptstandort oder Erfüllungsort: Universität Tübingen.

Rechtliche, wirtschaftliche, finanzielle und technische Informationen
Auftragsausführung
Wichtigste Finanzierungsbedingungen und Zahlungsmodalitäten und/oder Verweis auf die einschlägigen Bestimmungen, die sie regeln:

Anzahlungen bis zur Höhe vom max. 50 % des Kaufpreises werden nur gegen unbefristete Bankbürgschaft nach deutschem Recht geleistet.

Verfahren
Vergabekriterien
Kriterium: 1. Technischer Wert (50)
2. Preis (50)
Sprachen
Sprache: Deutsch 🗣️

Öffentlicher Auftraggeber
Identität
Andere Art des öffentlichen Auftraggebers: Other
Kontakt
Kontaktperson: Frau Christina Lindau
Internetadresse: www.dfg.de 🌏

Referenz
Kennungen
Vom öffentlichen Auftraggeber vergebene Referenznummer: EXC 307/2015
Zusätzliche Informationen

Das Aktenzeichen entsprechend Ziff. IV.3.1) ist bei sämtlicher Korrespondenz anzugeben.

Beim Schlusstermin laut Ziff. IV.3.4) handelt es sich um den Schlusstermin für den Eingang der Teilnahmeanträge (nicht für den Eingang der Angebote). Vor Ablauf des Schlusstermins gemäß Ziff. IV.3.4) werden keine Verdingungsunterlagen versendet.

Ergänzende Informationen
Körper überprüfen
Informationen zu Fristen für Nachprüfungsverfahren:

Das GWB (Gesetz gegen Wettbewerbsbeschränkungen) verpflichtet uns, Sie zu gegebener Zeit über die beabsichtigte Auftragsvergabe zu informieren. Hiergegen haben Sie die Möglichkeit, innerhalb einer festgelegten Frist vor der Vergabekammer des Bundes, Villemombler Str. 76, 53123 Bonn zu klagen. Im Falle einer fristgerechten Klage erbitten wir eine entsprechende Information.

Quelle: OJS 2016/S 003-002463 (2016-01-04)

Bekanntmachung über vergebene Aufträge (2016-07-25)
Objekt
Metadaten der Bekanntmachung
Dokumenttyp: Bekanntmachung über vergebene Aufträge

Verfahren
Angebotsart: Entfällt

Referenz
Daten
Absendedatum: 2016-07-25 📅
Veröffentlichungsdatum: 2016-07-28 📅
Kennungen
Bekanntmachungsnummer: 2016/S 144-260606
Verweist auf Bekanntmachung: 2016/S 003-002463
ABl. S-Ausgabe: 144

Objekt
Umfang der Beschaffung
Referenznummer: EXC 307/2015 (A 717)-3014046
Ort der Leistung
Hauptstandort oder Erfüllungsort: Tübingen.

Auftragsvergabe
Datum des Vertragsabschlusses: 2016-07-25 📅
Name: NIKON GmbH
Postanschrift: Tiefenbroicher Weg 25
Postort: Düsseldorf
Postleitzahl: 40472
Land: Deutschland 🇩🇪
E-Mail: mikroskope@nikon.de 📧
Internetadresse: www.nikoninstruments.eu 🌏
Informationen über Ausschreibungen
Anzahl der eingegangenen Angebote: 4
Quelle: OJS 2016/S 144-260606 (2016-07-25)

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