Massenspektrometer

Deutsche Forschungsgemeinschaft e.V., Zentrale Beschaffungsstelle

Beschaffung eines Massenspektrometers (DFG-GZ: A 616). Das Gerät wird benötigt zur Durchführung von ungerichteten Metabolitenanalysen verschiedener Pflanzen- und Pilzspezies. Dabei werden entwicklungsbedingte Änderungen von Metabolitenprofilen mittels ultraschneller Chromatographie und hochauflösender Massenspektrometrie in Hochdurchsatz-Analysenreihen bestimmt. Für die chromatographische Trennung wird ein Ultrahochdruck-Flüssigkeitschromatographie-System mit einem Druckbereich bis mindestens 1 000 bar und einem geringen Systemtotvolumen benötigt, um sub-2μm-Säulenmaterialen für eine effiziente Trennung einsetzen zu können. Daraus resultierende Signalbreiten von etwa 0,5 s erfordern eine ultraschnelle Detektion. Diese soll zum einen spektroskopisch im UV/Vis-Bereich mit Hilfe eines schnellen und sensitiven Photodiodenarray-Detektors mit einem Detektionsbereich von 190 bis etwa 600 nm erfolgen. Desweiteren wird eine auf Massenspektrometrie basierte Detektion zum Einsatz kommen, die ebenfalls auf das chromatrographische System abgestimmt sein muss. Deshalb wird eine Datenaufnahmegeschwindigkeit von mindestens 20 Scans/s im MS-Modus benötigt. Die Metabolitenidentifizierung erfordert eine Massenauflösung von etwa 40 000 und eine Massengenauigkeit von mindestens 1 ppm bis 300 Da und mindestens 3 ppm bis 1 500 Da. Für die komplexe Beschreibung von Metabolitenprofilen sind eine Empfindlichkeit bis in den Femtogramm-Bereich und ein linearer Sensitivitätsbereich über 5 Größenordnungen notwendig. Neben der Molekularmassenbestimmung ist auch eine Ionenfragmentbasierte Strukturaufklärung unerlässlich, die eine MS/MS-Option des Massenspektrometers voraussetzt. Hier wird eine Massengenauigkeit von 2 bis 5 ppm und eine Datenaufnahmegeschwindigkeit von etwa 10 Scans/s verlangt. Das massenspektrometrische System sollte desweiteren eine hohe Thermostabilität sowie eine robuste und einfache Betriebsweise aufweisen. Zur Prozessierung der generierten Messdaten werden Software-Systeme benötigt, die sowohl differentielle Datenanalysen also auch statistische Auswertungen ermöglichen. Dazu zählen Programme zur Datenfilterung nach ANOVA, Kruskal-Wallis und Bonferroni und zur Metabolitenbasierten Clusterung und Visualisierung. Für die Metabolitenidentifizierung soll eine akkurate Summenformel-Berechnung basierend auf der Isotopenverteilung und MS/MS-Datenbanken zum Einsatz kommen. Auch eine Rekonstruktion von Stoffwechselwegen mittels Abfrage von Literaturdatenbanken ist notwendig.

Die Frist für den Eingang der Angebote war 2010-10-29. Die Ausschreibung wurde veröffentlicht am 2010-10-15.

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