Beschreibung der Beschaffung
Es werden drei modular aufbauende Pipettierautomaten mit hoher Pipettiergenauigkeit und Reproduzierbarkeit für eine RNA/DNA-basierte Bibliothekserstellung für die Next-Generation-Sequenzierung benötigt. Hierbei müssen die Protokolle zur Vorbereitung von folgenden Biblio-theken durchführbar sein:
Humangenetik:
a) Twist Library Preparation Kit EF 2.0
b) Agilent SureSelect XT HS2 DNA System
GDI für Pathologie:
a) OncoDNA / Twist: OncoDEEP
b) Illumina: TruSight RNA Fusion
c) Illumina: Illumina DNA Prep with Enrichment
Ferner müssen die Pipettierautomaten für die Verwendung verschiedener, herstellerunab-hängige Flüssigkeiten ausgelegt sein und eine genaue Einstellung des Pipettiervorgangs ohne manuelle Intervention ermöglichen. Für die Probenaufbereitung muss eine Aufreinigung von PCR-Produkten nach der "Magnetic Bead" Methode möglich sein. Der Probenlauf muss über eine frei durch den Anwender wählbare Probenanzahl verfügen und an definierten Start/Stopp Punkten gestartet, weitergeführt oder beendet werden können.
Folgende Mindest-Anforderungen und Funktionen müssen eingehalten werden (Pipettierau-tomat 1; 2x ? Humangenetik und GDI für Pathologie):
- Konfigurierbare Deckpositions-Arbeitsfläche für Spitzenboxen, Mikrotiterplatten und andere Labware.
- Mindestens 40 Deckpositionen.
- Flexibler 8-Kanal Pipettierkopf mit einem Arbeitsvolumen von mindestens 1000µl und kapazitiver Füllstandsmessung.
- Mehrkanal Pipettierkopf mit 96 Kanälen und einem Arbeitsvolumen von mindestens 300µl.
- Zwei bewegliche Greifarme (360° Rotation) zum Abfahren aller Deckpositionen.
- Integrierter PCR-Thermocycler für 96-Well-Platten.
- Integrierter Barcodereader für das Lesen von Platten und Probengefäßen.
- Temperier- und Schütteleinheit (4-70°C).
- Orbital-Schütteleinheit (min. 1800 U/min) mit Klemmvorrichtung für (Flachboden, Deep-Well, 96- und 384-Well-PCR-Platten)
- Temperiereinheit (4-100°C).
- Software mit grafischem Interface und Programmiermöglichkeit.
- Schnittstelle zum LIMS um Daten zu exportieren.
- Universelle Magnetplatte ("Magnetic Bead" Methode)
- Röhrchen Block / Racks
- Mobiler Arbeits-/Untertisch mit Rollen zur Aufnahme eines Pipettierautomaten.
Folgende Mindest-Anforderungen und Funktionen müssen eingehalten werden (Pipettierau-tomat 2; 1x ? Humangenetik):
- Konfigurierbare Deckpositions-Arbeitsfläche für Spitzenboxen, Mikrotiterplatten und andere Labware.
- Mindestens 20 Deckpositionen.
- Mehrkanal Pipettierkopf mit 96 Kanälen und einem Arbeitsvolumen von mindestens 300µl.
- Ein beweglicher Greifarm (360° Rotation) zum Abfahren aller Deckpositionen.
- Integrierter PCR-Thermocycler für 96-Well-Platten.
- Integrierter Barcodereader für das Lesen von Platten und Probengefäßen.
- Temperier- und Schütteleinheit (4-70°C).
- Orbital-Schütteleinheit (min. 1800 U/min) mit Klemmvorrichtung für (Flachboden, Deep-Well, 96- und 384-Well-PCR-Platten)
- Temperiereinheit (4-100°C).
- Software mit grafischem Interface und Programmiermöglichkeit.
- Schnittstelle zum LIMS um Daten zu exportieren.
- Universelle Magnetplatte ("Magnetic Bead" Methode)
- Röhrchen Block / Racks
Abweichungen von diesen Forderungen müssen gesondert erklärt werden.
Leistungs- und Bedarfszahlen am Institut für Humangenetik:
NGS Analysen ca. 3000 pro Jahr.
NGS basierte Probentracking-Analysen ca. 7000 pro Jahr.
Leistungs- und Bedarfszahlen am Institut für Pathologie:
NGS Analysen ca. 4000-6000 pro Jahr.
III. Sonstige Anforderungen für die Beschaffung der Geräte
Die Systeme müssen nahtlos in eine LIMS-Umgebung eingebunden werden. Die modalitä-tenseitige Integration ist Bestandteil des Auftrags.
Die Aufstellung der zu beschaffenden Systeme soll am Institut für Humangenetik, Vesalius-weg 12-14 und am Gerhard-Domagk-Institut für Pathologie, Domagkstraße 17 erfolgen. Er-setzt werden am Institut für Humangenetik zwei Biomek 3000 der Firma Beckman & Coulter aus den Jahren 2009 und 2012. Die Demontage und Entsorgung erfolgt durch den Auftrag-geber. Die Räumlichkeiten können besichtigt werden, alle notwendigen Auskünfte werden erteilt. Grundrisspläne für den Raum liegen vor. Weitere Informationen können erfragt wer-den.